不得不说，日本还是有狂信徒的。即使在德川幕府的禁教政策之下，大部分信徒不得不转入地下活动，但是他们还没有放弃信仰。
但是，真正的最致命的打击，也正是因为这个原因。
在锁国期间，天主教徒受到残酷血腥的镇压，日本天主教徒的数量急剧下降。但是，仍然有一部分人偷偷信仰天主教”其中以天主教主要的根据地九州为主要集中地。也就是这里”爆发了标志日本天主教徒最后一次奋迅的“岛原之乱”。
1634年起，岛原、天草地区连续发生天灾，导致民不聊生。在幕府的残暴统治之下，以天主教徒为主的民众，终于爆发了江户时代最大的一次“邪教暴动”岛原之乱。
（尽管教科书上把这次暴动叫“农民起义”，但是作者觉得，还是叫“邪教暴动”比较合适。因为其领导、骨干都是信徒，而且都是贵族和武士”不是普通农民。还有明确的宗教式的宗旨，无论怎么看，都和农民不搭边。）
岛原之乱的领导人天草四郎，本名益田时贞，父亲益田好次是小西井长的家臣。后来时贞被过继给天草甚兵卫，改名为天草时责。天草自小聪颖过人，有神童之称，且外表俊秀。有一位相士曾对天草说：“阁下面相尊贵，本应掌握天下，只可惜生在德川时代，难成大事。
天草接受天主教思想，在民众中宣传“天地本同根，万物是一体，其间并无尊卑之别”的教义，被教民奉为“天童”。
1637年，天草四郎领导了岛原、天草的信徒暴动”史称“岛原之乱”。
岛原之乱的领导人，大多是在大坂冬、夏之阵中逃出来的西军浪人，其中大部分是西军的天主教徒。西军战败之后，站错队的大多数大名不是被没收”就是被减封。老大都保不住了，小弟就更不用说了，很多武士都丢掉了饭碗。
其中一部分在失去主君之后，就逃到了岛原、天草等地方。其中比较著名的有出仕天草家、志岐家的“天草五人众”等豪族。他们招募各地浪人，最终推举天草四郎作为总大将。
在天草四郎的领导下，起义军迅速占领岛原半岛南部的原城，于城上竖立起十字架，挂上画有十字架和圣像的旗帜。他们宣布要推翻幕府，建立“地上天国”，成立天主教信仰的新政府。据统计，参加暴动的教民共三万七千余人，其中有战斗力的为一万三千余人。
同年12月，幕府先后接到岛原、天草农民起义的消息，急忙派遣板仓重昌为幕府毒使，赴九州领导镇压起义军。板仓到
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